产品及特点
酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae )又称面包酵母或出芽酵母,是一种与人类关系广泛的酵母。其细胞为球形或卵形,直径5-10 μm,繁殖方法为出芽生殖。酿酒酵母被广泛应用于食品、医药等领域。因此,快速检测酿酒酵母感染具有重要意义。本产品就是以探针法qPCR技术为基础开发的专门检测酿酒酵母感染的试剂盒,它具有下列特点:
1. 即开即用,用户只需要提供样品DNA模板
2. 引物和探针经过优化,分析灵敏性高,可以达到100拷贝/反应。
3. 提供阳性对照,用于制备标准曲线和用作扩增对照,排除假阴性实验。
4. 提供外源性内参,便于排除PCR假阴性样本。
5. 特异性高,靶分子的引物和探针是根据酿酒酵母DNA高度保守区设计,不会跟其他生物的DNA发生交叉反应。
6. 既可用于定性检测,又可用于定量检测。定量检测时线性范围至少为5个数量级。
7. 本产品足够50次20μL体系的探针法PCR反应。
8. 本产品只能用于科研。
规格及成分
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成分
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规格
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包装
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2×Probe qPCR MasterMix
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500μL
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0.5mL本色管
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荧光PCR专用模板稀释液
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1mL
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1.5mL绿盖管
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酿酒酵母PCR引物-探针干粉(含内参引物探针)
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50次
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0.5mL棕盖管
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酿酒酵母PCR阳性对照(1E7拷贝/μL)
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50μL
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0.5mL黄盖管
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外源性内参(1E4拷贝/μL)
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250μL
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0.5mL白盖管
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使用手册
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1份
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无
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本产品采用五孔盒包装
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注 意:引物-探针干粉在使用前需要短暂离心,然后在离心管中加入220μL超纯水充分混匀后再使用,未用完的需要-20℃保存。
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使用方法
稀释标准曲线样品以阳性对照1E1-1E6拷贝/μL这6个10倍稀释度为例
1. 标记6个离心管,分别为6,5,4,3,2,1,0。
2. 在0号管中加入280 μL荧光PCR专用模板稀释液,35 μL本试剂盒提供的外源性内参,震荡一分钟混匀。
3. 用带芯枪头分别将上步得到的混合液按45 μL/管加入到标记的1-6号管中,用带芯枪头(下同)。
4. 在6号管中加入5 μL 1E7拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1E6拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
5. 换枪头,在5号管中加入5 μL 1E6拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1E5拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
6. 换枪头,在4号管中加入5 μL 1E5拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1E4拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
7. 重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线阳性样品,每个样品中内参的浓度固定为1E3拷贝/μL。放冰上待用。
样品DNA的制备
8. 如果有N个样品,设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制备阳性对照),一个是NC(样品制备阴性对照)。可以用10 μL上步所得4号稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求的体积一样,以此作为PC。另外用水作为NC。在所有待纯化样本、PC样本和NC样本中分别加入5 μL本试剂盒提供的外源性内参(共5千拷贝)。
9. 用自选方法纯化样品的DNA(含内参),本试剂盒跟市场上大多数DNA提取试剂盒兼容,也可以选购本公司的免提取核酸释放剂。
Probe qPCR反应20 μL体系,在样品制备室进行
10. 如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析并且只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),1个用于PCR阳性对照(直接用第6步第4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
数据处理
1. 阴性阳性判断:没有Ct读数,或Ct大于40判为阴性结果。有Ct读数,Ct值小于40,荧光信号有对数增长,有典型扩增曲线判为阳性结果。每个样本需要对FAM通道和Cy5通道的结果分别进行判定,得到两个结果。
2. 实验有效性判断:如果扩增阳性对照或制备阳性对照FAM通道结果为阴性则整个实验无效,不需要分析数据,需要分析原因,可能是操作、仪器和试剂三方面的原因,重做扩增或制备或跟仪器和试剂厂家联系。
3. 如果扩增阴性对照或制备阴性对照FAM通道结果为阳性,说明环境污染,则整个实验无效,不需要分析数据,需要分析失败原因,直到污染消除。如果阳性对照和阴性对照正常,则进入下一步分析样本的有效性。
4. 样本有效性判断:如果样本FAM通道的结果为阳性,则无论内参Cy5通道的结果是阴性还是阳性,样本的结果均有效。如果样本结果为阴性,内参通道结果也为阴性,则此样品的阴性结果无效。此样品需要重新提取核酸和进行扩增。
6. 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,分别以阳性对照FAM通道和内参Cy5通道的Ct值为纵轴,绘制标准曲线,阳性对照FAM通道读数的标准曲线为斜线,r2必须大于0.95,内参Cy5通道读数的标准曲线为一条跟X轴平行的横线。再以待测样品的Ct值从阳性对照FAM通道读数的标准曲线上推算出样品DNA浓度的log值,再推算出其浓度。
7. 如果用于定性实验,对待测样品,如果其FAM通道的Ct没有读数、或Ct大于或等于40则均为阴性,如果小于40则为阳性。对任何FAM通道结果为阴性的待测样本,如果其对应的内参Cy5通道也为阴性,则此样品的阴性结果无效,此样品需要重复实验。样本,如果其对应的内参Cy5通道也为阴性,则此样品的阴性结果无效,此样品需要重复实验。
自备试剂
样品DNA
运输及保存
低温运输,-20℃保存,有效期1年