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产品及特点
胡萝卜软腐欧文氏菌马铃薯黑胫亚种(erwinia carotovora subsp atroseptica)是是一种革兰氏阴性、好氧或兼性厌氧菌。菌体短杆状，单细胞，极少双连，周生鞭毛，具荚膜，大小为（1.3-1.9）微米×（0.53-0.60）微米。它是一种重要的植物病原细菌。可以通过种植带菌传播，也可以通过灌溉水、雨水、昆虫等途径传播，可以引发多种植物病害。其中在马铃薯上引起的病害通常称为黑胫病，除了马铃薯黑胫病外，还能引起其他作物如胡萝卜、芹菜、大白菜、辣椒、西葫芦等作物的软腐病。胡萝卜软腐欧文氏菌马铃薯黑胫亚种是一种对农作物具有高度破坏力的病原体，导致作物产量显著下降，经济损失严重。此外，由于该细菌可以在土壤中存活，导致某些田块持续多年受到影响，给农业生产和农民的经济收入带来巨大损失。因此快速检测胡萝卜软腐欧文氏菌马铃薯黑胫亚种具有重要的意义。为此，本公司以探针法qPCR技术为基础开发了胡萝卜软腐欧文氏菌马铃薯黑胫亚种的检测试剂盒，它具有下列特点：
胡萝卜软腐欧文氏菌马铃薯黑胫亚种(erwinia carotovora subsp atroseptica)是是一种革兰氏阴性、好氧或兼性厌氧菌。菌体短杆状，单细胞，极少双连，周生鞭毛，具荚膜，大小为（1.3-1.9）微米×（0.53-0.60）微米。它是一种重要的植物病原细菌。可以通过种植带菌传播，也可以通过灌溉水、雨水、昆虫等途径传播，可以引发多种植物病害。其中在马铃薯上引起的病害通常称为黑胫病，除了马铃薯黑胫病外，还能引起其他作物如胡萝卜、芹菜、大白菜、辣椒、西葫芦等作物的软腐病。胡萝卜软腐欧文氏菌马铃薯黑胫亚种是一种对农作物具有高度破坏力的病原体，导致作物产量显著下降，经济损失严重。此外，由于该细菌可以在土壤中存活，导致某些田块持续多年受到影响，给农业生产和农民的经济收入带来巨大损失。因此快速检测胡萝卜软腐欧文氏菌马铃薯黑胫亚种具有重要的意义。为此，本公司以探针法qPCR技术为基础开发了胡萝卜软腐欧文氏菌马铃薯黑胫亚种的检测试剂盒，它具有下列特点：
1. 即开即用，用户只需要提供样品DNA模板。
2. 引物和探针经过优化，分析灵敏度高，可以达到100拷贝/反应。
3. 提供阳性对照，便于区分假阴性样品。
4. 特异性高，引物是根据胡萝卜软腐欧文氏菌马铃薯黑胫亚种DNA高度保守区设计，不会跟其他生物的DNA发生交叉反应。
5. 既可用于定性检测，又可用于定量检测。定量检测时线性范围至少为5个数量级。
6. 本产品足够50次20 μL体系的探针法qPCR反应。
7. 本产品只能用于科研。
规格及成分
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成分 |
规格 |
包装 |
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2×Probe qPCR MasterMix |
0.5mL |
0.5mL本色管 |
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荧光PCR专用模板稀释液 |
1mL |
1.5mL绿盖管 |
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超纯水 |
1mL |
1.5mL蓝盖管 |
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胡萝卜软腐欧文氏菌马铃薯黑胫亚种qPCR引物-探针干粉 |
50次 |
0.5mL棕色管 |
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胡萝卜软腐欧文氏菌马铃薯黑胫亚种qPCR阳性对照(1×1E7拷贝/μL) |
50μL |
0.5mL黄盖管 |
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使用手册 |
1份 |
无 |
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本产品采用五孔盒包装 |
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注 意：引物-探针干粉在使用前需要短暂离心，然后在离心管中加入165 μL的超纯水充分混匀后得到引物-探针混合液再使用，未用完的需要-20℃保存。 |
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使用方法
稀释标准曲线样品以1E1-1E6拷贝/μL这6个10倍稀释度为例
由于标准品浓度非常高，因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行，千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原，本产品不提供活体样品做阳性对照，只提供无传染性的DNA片段作为阳性对照。
稀释标准曲线样品以1E1-1E6拷贝/μL这6个10倍稀释度为例
由于标准品浓度非常高，因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行，千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原，本产品不提供活体样品做阳性对照，只提供无传染性的DNA片段作为阳性对照。
1. 标记6个离心管，分别为6、5、4、3、2、1。
2. 用带芯枪头分别加入45 μL荧光PCR专用模板稀释液，用带芯枪头，下同）。
3. 在6号管中加入5 μL 1E7拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供)，充分震荡1分钟，得1E6拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
4. 换枪头，在5号管中加入5 μL 1E6拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得)，充分震荡1分钟，得1E5拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
5. 换枪头，在4号管中加入5 μL 1E5拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得)，充分震荡1分钟，得1E4拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
6. 重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
样品DNA的制备
7. 如果有N个样品，设置N+2个提取，多出的一个是PC（样品制备阳性对照），一个是NC（样品制备阴性对照）。可以用10 μL上步所得第4号稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次样本制备所要求的起始样本体积一样，以此作为PC。另外用水作为NC。
8. 用自选方法纯化样品的DNA，本试剂盒跟市场上大多数DNA提取试剂盒兼容，也可以选购本公司的免提取核酸释放剂。
Probe qPCR反应20 μL体系，在样品制备室进行
9. 如果做定量分析并且只做1次重复，则标记N+9个PCR管，其中N+2个用于上步得到的N+2个样品，1个用于PCR阴性对照（用水做模板），6个用于标准曲线。如果做定性分析并且只做1次重复，则标记N+4个PCR管，其中N+2个用于上步得到的N+2个样品，1个用于PCR阴性对照（用水做模板），1个用于PCR阳性对照（直接用第6步第4号管的阳性对照稀释液做模板）。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
数据处理
1. 如果样本制备阳性对照或PCR阳性对照(包括标曲样本)结果为阴性，则整个实验无效，不需要分析数据，需要重新样本制备，重新进行PCR扩增或跟厂家联系。如果样本制备阴性对照或PCR阴性对照结果为阳性，说明环境污染，则整个实验无效，不需要分析数据，需要跟厂家联系。
2. 如果阴性对照和阳性对照均正常，则实验有效，可以进入后续分析。
3. 如果把本试剂盒用于定量检测，则以阳性对照浓度的log值为横轴，以Ct值为纵轴，绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品DNA浓度的log值，再推算出其浓度。
4. 如果把本试剂盒用于定性检测，只判断阳性或阴性，则阴性对照Ct必须没有读数，或者大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长，有典型扩增曲线，Ct值应该小于40。对待测样品，如果其Ct没有读数、大于或等于40则均为阴性，如果小于40则为阳性。
自备试剂
样品DNA，超纯水，核酸纯化试剂盒
样品DNA，超纯水，核酸纯化试剂盒
运输及保存
低温运输，-20℃保存，有效期1年
低温运输，-20℃保存，有效期1年
