产品及特点
本产品是以探针法荧光定量PCR技术为基础开发的专门检测丹毒丝菌的试剂盒。丹毒丝菌(Erysipelothrix)是一类革兰氏染色阳性菌,在自然界中广泛存在。丹毒丝菌属起的丹毒丝菌病是一种急性细菌性疾病,其病理特征为在感病动物皮肤上形成红色凸起的斑块。丹毒丝菌感染人和多种动物,严重影响人和动物健康,因此快速检测丹毒丝菌属具有重要意义。
本产品具有下列特点:
1. 即开即用,用户只需要提供样品DNA模板。
2. 引物和探针经过优化,灵敏度高,检测限可达100拷贝/反应。
3. 提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
4. 特异性高,引物是根据丹毒丝菌属基因组DNA高度保守区设计,不会跟其它生物的DNA发生交叉反应。
5. 既可用于定性检测,又可用于定量检测。用于定量检测时,线性范围至少5个数量级。
6. 本产品足够50次20 μL体系的探针法荧光定量PCR反应。
7. 本产品只能用于科研。
规格及成分
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成分
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规格
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包装
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2×Probe qPCR MasterMix
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500μL
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0.5mL本色盖
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荧光PCR专用模板稀释液
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1mL
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1.5mL绿盖管
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超纯水
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1mL
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1.5mL蓝盖管
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丹毒丝菌属qPCR引物-探针干粉
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50次
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0.5mL白盖管
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丹毒丝菌属阳性对照(1×10E7拷贝/μL)
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50μL
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0.5mL黄盖管
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使用手册
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1份
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无
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本产品采用五孔盒包装
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注 意:引物-探针干粉在使用前需要离心,然后在离心管中加入165mL的超纯水充分混匀后再使用,未用完的需要-20℃保存。
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使用方法
稀释标准曲线样品以1E1-1E6拷贝/μL这6个10倍稀释度为例
由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的DNA片段作为阳性对照。
1. 标记6个离心管,分别为6、5、4、3、2、1。
2. 用带芯枪头分别加入45 μL荧光PCR专用模板稀释液,用带芯枪头,下同)。
3. 在6号管中加入5 μL 1E7拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1E6拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
4. 换枪头,在5号管中加入5 μL 1E6拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1E5拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
5. 换枪头,在4号管中加入5 μL 1E5拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1E4拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
6. 重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
样品DNA的制备
7. 如果有N个样品,设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制备阳性对照),一个是NC(样品制备阴性对照)。可以用10 μL上步所得第4号稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次样本制备所要求的起始样本体积一样,以此作为PC。另外用水作为NC。
8. 用自选方法纯化样品的DNA,本试剂盒跟市场上大多数DNA提取试剂盒兼容,也可以选购本公司的免提取核酸释放剂。
Probe qPCR反应20 μL体系,在样品制备室进行
9. 如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析并且只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),1个用于PCR阳性对照(直接用第6步第4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
数据处理
1. 如果扩增阳性对照或制备阳性对照结果为阴性,则整个扩增或制备实验无效,不需要分析数据,需要重做扩增或制备或跟厂家联系。如果扩增阴性对照或制备阴性对照结果为阳性,说明环境污染,则整个扩增或制备实验无效,不需要分析数据,需要跟厂家联系,购买新的引物和探针。
2. 如果阴性对照和阳性对照正常,则实验有效,可以进入后续分析。
3. 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品DNA浓度的log值,再推算出其浓度。
4. 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照必须无Ct或Ct大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于40,否则实验无效。如果实验有效,则分析待测样品,如果无Ct或Ct大于或等于40,则为阴性。如果Ct小于40则为阳性。
自备试剂
超纯水,样品DNA
运输及保存
低温运输,-20℃保存,有效期2年